当临床应用干细胞治疗时，选择哪个代次的干细胞治疗更加合适，是经常容易被问及的。这些都是应该思考和有待解决的问题。我们都是知道，人分男女老少，而干细胞也有年轻和衰老之分，因此，细胞的代数是影响干细胞活性及临床有效性、安全性的一个重要因素。
理论上讲，细胞代数越靠前，干细胞的干性也越强。但是干细胞在体外培养的过程中，干细胞有从组织微环境到体外培养环境的一个调整和适应过程，一部分不适应的细胞会被淘汰，所以在前两三代，干细胞基因组有着不稳定的因素，可能不宜临床应用。
有研究显示，通过核型分析发现，在前三代细胞中，干细胞存在异常核型的比例偏高。就如间充质干细胞（MSC）而言，临床应用的最佳代数应该在 4~6 代。
细胞传代
体外培养时，细胞在培养瓶中的生长过程主要分为 4 个阶段（如下图）：
过了延滞期后，细胞开始分裂，进入对数生长期。此阶段，细胞数量急速增加。
细胞数量增加到一定程度时，细胞相互接触，产生接触抑制，细胞分裂生长速度减慢，直至完全停止生长，进入稳定期。
进入稳定期后，由于培养基中营养物质消耗，有害代谢产物积聚，细胞死亡数逐渐增加，进入衰亡期。
因此，为了避免大规模细胞死亡，细胞在进入稳定期时应及时消化，并重新接种到新的培养瓶中，这称为细胞传代。
备注：P0为刚从组织分离出来的原代细胞，一般干细胞传代扩增倍数为3-5倍，图表中以3倍为例。
间充质干细胞理论上可以长期传代培养，但在临床应用中不建议选择代次较高的干细胞批次。未经体外扩增的MSC，细胞本身是安全无害的，除非本身有某种基因缺陷，体外扩增最大的风险在于基因突变。有一研究小组发现骨髓MSC体外培养至18代时，出现基因突变、染色体异常。其他大量的研究证实，MSC在体外培养代数过高（超过10代）的情况下才会引起染色体异常。
另一个影响干细胞回输安全性的问题是添加物，如使用无血清培养基代替动物血清培养；通过严格的无菌操作避免抗生素的使用。但对于胰酶等细胞培养不可替代的成分，要在回输时严格质检以确保其无成分残留，也是至关重要的。
因此，代次太靠前或者太靠后都不是最好的选择，同时也要考虑培养条件的因素才能做出最佳的选择。
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